Unités d’Enseignement (UE) Parcours Standard/Recherche

• Méthodes en épidémiologie descriptive
• Les différents types d’enquête analytique
• Principes généraux de l’analyse d’une enquête
• Régression logistique 
• Introduction à R et R studio ; éléments de langage ; manipulation de vecteurs
• Statistiques descriptives, principaux tests statistiques
• Modèles linéaires généralisés
• Données de survie
• Importation/exportation de données, analyses de survie
• Outils graphiques
• Blocs d’instruction, tests logiques et boucles ; programmation fonctionnelle
• Recherche reproductible et bonnes pratiques

• La valorisation de la recherche appliquée, l’innovation biomédicale Pourquoi et comment développer un projet innovant
  avec l’industrie ? La protection de l’innovation
• Les financements publics de la Recherche-Développement biomédicale La brevetabilité du vivant
• Formation et enjeu d’une équipe commerciale pour une entreprise Innovation en biologie: histoire d’un transfert
• Comment négocier un contrat de collaboration et de transfert avec un industriel ? Les structures juridiques pour développer la recherche
• Que peut apporter de nouveau une SATT ?
• Comment motiver une équipe de recherche au transfert industriel ?
• Le cas de l’industrie pharmaceutique est-il applicable à l’industrie des dispositifs médicaux ? Les principes du transfert de technologies et création d’entreprise.
• Protection des logiciels, copyright
• Apport du CNRS à la compétitivité des industries de santé de l’hexagone Capital-risque et recherche. Le business-plan : moyen de convaincre Création d’entreprise issue de projets hospitaliers
• Qu’attend un industriel d’un partenariat avec une structure de recherche publique ? Atelier Curriculum Vitae
• Processus d’accès au marché des médicaments
• Stratégie d’innovations au sein de l’industrie pharmaceutique Protection des personnes et Recherche clinique
• La déclaration d’invention: Première étape de l’innovation
• Enjeux de la valorisation industrielle au sein d’un établissement public de recherche
• Financement d’innovations et développement d’entreprise Un métier mal connu : chasseur de dirigeants
• Déjeuner-rencontre avec des industriels du GBM Stratégie industrielle de l’innovation
• Pourquoi et comment faire une étude de marché ? Les règles d’achats des marchés publics à l’hôpital
• Comment manager une équipe médicale ou de recherche ? Principe de précaution et innovation sont-ils compatibles ? Intelligence économique. Enjeux pour la recherche et la santé
• Apport des Business Angels à la valorisation de la recherche biomédicale Télématique de santé : innovations et enjeux
• L’articulation recherche clinique-industrie aux USA (visioconférence) Application des Directives européennes aux dispositifs médicaux Procédures d’accès aux remboursements des dispositifs médicaux
• Les financements européens de la Recherche et Développement dans le domaine de la santé Les procédures d’évaluation et de Normalisation du matériel médical
• Recherche académique et partenariats industriels au Nouveau Brunswick (visioconférence) Le partenariat médecins-industriels à l’IRCAD (visioconférence)
• Veille technologique : enjeux, principes généraux, éléments de méthode La gestion du risque en aéronautique est-elle applicable en médecine ? Faire carrière au sein de l’industrie du GBM
• Les bases techniques du curriculum vitae et de l’entretien d’embauche Métiers, et futur des Biotechs et de l’industrie pharmaceutique
• Veille stratégique dans l’entreprise – Applications concrètes par mise en situation

• Journaux scientifiques, classification, ou envoyer ? Différents type d’articles publiés
• Articulation globale d’un article original Processus de publication
• Différents modèles d’accès Cover letter
• Le choix des mots, règles de typologie et structure des phrases Titre et Abstract
• Style littéraire, figures, tableaux et conseils pour la rédaction Optimisation de la recherche bibliographique
• L’intégrité scientifique Les conflits d’intérêt
• Le point de vue du reviewer
• Le point de vue de l’éditeur en chef
• Rationnel et modalité de soumission d’abstract pour congres scientifique Présentation orale et poster
• EQUATOR et les recommandations pour le reporting Conduite d’une revue de la littérature
• Où soumettre son article ? Bibliométrie et promotion personnelle Le point de vue de l’éditeur en chef
• Equator et les recommandations pour le reporting Conduite d’une revue de la littérature

• Cellules souches et pelvi-périnéologie Organes artificiels et pelvi-périnéologie
• Bio-technologie des implants dans la chirurgie de l’incontinence Bio-ingenierie et renforts prothétiques
• Recherche sur la prévention et le traitement des cancers pelviens Recherche sur le traitement chirurgical de l’endométriose Caractérisation et comportement des tissus pelviens
• Modèle anatomique et modélisation biomécanique pelvienne Les facteurs du vieillissement prostatique
• Imagerie fonctionnelle IRM en recherche en obstétrique Recherche clinique sur les positions de l’accouchement
• Recherche clinique et intervention obstétricale (forceps, épisiotomie, césarienne) Recherche clinique et évaluation des troubles sexuels de la femme
• Modèles animaux d’incontinence et recherche translationnelle
• Bio-Marqueurs en pelvi-périnéologie
• Recherche et cancer prostatique

• Réflexes périnéaux et continence urinaire à l’effort chez la femme Cognition et continence urinaire à l’effort chez la femme Vieillissement de la vessie et de son innervation
• Evaluation de la sensibilité urethro-vésicale en recherche Attention, émotion et contrôle vésical
• Modélisation mathématique de la miction Contrôle sensori-moteur de l’activité vésicale
• Les réflexes uréthraux Réflexe vésical au froid
• Physiopathologie de l’hyperactivité vésicale Physiopathologie de l’hypoactivité vésicale
• Technologies non invasives de l’analyse de l’activité vésicale Lois hydrodynamiques. Expérimentation urodynamique in vitro Traitement du signal EMG en recherche et en pratique
• Le post traitement du signal biologique
• Analyse instrumentale de la douleur vésico-pelvienne en recherche Analyse en recherche des réflexes sacrés
• Analyse en recherche du système nerveux autonome Motricité digestive chez l’homme
• Viscero-sensibilité chez l’homme
• Algorythmes et systèmes experts en pelvi-perineologie Recherche en neuro-anatomie pelvi-vésicale
• Neuro-histochimie de l’épithélium vésical
• Fatigue et fatigabilité pelvi-périnéale : concept et recherche Tonicité et spasticité pelvi-périnéale : concepts et recherche
• Construction, validation des échelles de symptomes et de qualité de vie
• Evaluation clinique et instrumentale de la contraction musculaire périnéale dans les protocoles de recherche clinique
• Evaluation clinique et instrumentale de la fonction sexuelle chez l’homme dans les protocoles de recherche clinique
• Recherche, hypnose et comportement neuro-digestif Microbiote, microbiome et régulation neuro-viscérale Recherche en Neuromodulation des fonctions digestives

• Recherche clinique cardiovasculaire : Etat des lieux, modes d’organisation – Réseau FACT
• From bedside to clinical trial – La naissance d’un essai thérapeutique en Cardiologie – Réseau ACTION Les Success Story des Essais thérapeutiques – Pharmacologie Part 1 – PCSK9
• Les Success Story des Essais thérapeutiques – Pharmacologie Part 2 – CYP2C19 et nouveaux P21Y12 Les Success Story des Essais thérapeutiques – Device – TAVI
• Apprendre de ses erreurs : Leçons des grands essais – Pharmacologie Part 1 – Ciclosporine
• Apprendre de ses erreurs : Leçons des grands essais – Pharmacologie Part 2 – Ivabradine
• Apprendre de ses erreurs : Leçons des grands essais – Device – La Dénervation Rénale

Modalités de la recherche clinique en cardiologie

• Organisation en réseau – Exemple FCRIN
• Recherche Industrielle – Médicaments (ATLANTIC – ALPHEUS (AstraZeneca) – ATLANTIS
• Recherche Translationnelle en partenarait avec l’ INSERM et autres plateformes de recherche fondamentale Recherche Translationnelle et IHU – IHU ICAN
• Spécificités méthodologiques des essais en cardiologie Etudes médico-économiques

Athérothrombose et maladie coronaire

• Prévention primaire – recherche en HTA Athérome : Plaque et stabilisation thérapeutique antiplaquettaire Anticoagulant IV
• Les devices en angioplastie : de l’angioplastie au ballon aux stents du futur Etudes de stratégie dans la revascularisation myocardique – FFR

Insuffisance cardiaque

• Génétique des Cardiomyopathies : intérêt en recherche clinique
• Recherche pharmacologique dans l’Insuffisance Cardiaque
• Devices en Insuffisance cardiaque – Resynchronisation
• Assistance Cardiaque -Coeur Artificiel – Côté réanimation
• Assistance Cardiaque -Coeur Artificiel – Greffe Cardiaque – Côté Chirurgie
• Thérapie cellulaire : Cellules souches et IPS

Rythmologie

• Génétique des cardiopathies rythmiques Anticoagulants oraux
• Rythmologie interventionnelle : Stimulation et Pace Makers Rythmologie interventionnelle : Ablations
• Recherche en Epidémiologie

Interventionnel « structurel »

• TAVI et recherche clinique Interventionnel valvulaire mitral. Fermeture Auricule Gauche
• Foramen Ovale Perméable (FOP) / Communication InterAuriculaire (CIA)

Méthodes d’imagerie en recherche clinique cardiovasculaire

• Principes physiques
• Apport de l’imagerie en coupe (IRM – scanner) pour la recherche clinique Etude de la morphologie cardiaque (diamètre, volume, géométrie cardiaque)
• Hémodynamique intracardiaque (débit, surfaces, pressions, résistances, volume de régurgitation) Phénotypage de l’insuffisance cardiaque par imagerie
• Recherche en imagerie fonctionnelle
• Phénotypage de la cardiopathie ischémique par imagerie Phénotypage des valvulopathies en imagerie Phénotypage dans les AVC par imagerie cardiaque

Cardio Oncologie – Toxicité cardiaques des chimiothérapies et de la radiothérapie

• Toxicité cardiaque des anthracyclines Dysfonction VG et Insuffisance cardiaque
• Hypertension artérielle, SCA, AVC, arythmies Toxicité Vasculaire des Chimiothérapies et HTAP Toxicité cardiaque de la radiothérapie
• Dépistage de la cardiotoxicité et Cardioprotection

Journée Cœur – Infection et Cœur et Rein infection

• Péricardite et Myocardite : Analyse des essais thérapeutiques. Présentation du registre de la SFC. VIH et Complications cardiovasculaires
• VHC et complications cardiovasculaires
• Endocardite : Epidémiologie récente. Nouveaux traitements antibiotiques Maladies tropicales et atteinte cardiovasculaire
• Complications cardiovasculaire dans l’insuffisance rénale (Registre REIN) et Stratification du risque CV Le Syndrome cardio-rénal
• Apport du néphrologue dans le traitement de l’insuffisant cardiaque

Ateliers pratiques

• Critique d’article : Partie 1 Critique d’article : Partie 2 Rédaction d’un protocole Rédaction d’un dossier de bourse
• Rédaction d’une lettre d’intention (PHRC/PRME) Rédaction d’un CRF
• Rédaction d’une demande auprès d’un CPP
• Outils Informatique pour la Recherche (Excell, Statistiques, Prism). Problématique des critères d’évaluation , de substitution ou composites Learn from an Editor of the New England Journal of Medecine

Brochure de l’investigateur – Le dossier d’AMM : les étapes de la mise sur le marché
Attractivité de la recherche industrielle – Particularités des essais internationaux
Valorisation publique et privée
Contrôle de la publicité des médicaments
Présentation du secteur du DM et de ses caractéristiques
Le cadre réglementaire de l’évaluation clinique des DM
Les référentiels des évaluations cliniques du DM
Suivi des études, déclaration des EIG
Les spécificités nationales
La Commission d’AMM + Transparence
Circuit du médicament dans les essais cliniques
L’infirmière de recherche clinique
Programmes Hospitaliers de Recherche Infirmière et paramédicale

Comment s’assurer de la faisabilité de l’essai clinique avant le démarrage ?
Choix des investigateurs et visite initiale
Visites intermédiaires sur site
TEC et organisation des essais
Élaboration d’un CRF – Remplissage de CRF/saisie
Rôle et responsabilité des chefs de projets
Le rôle de l’ARC dans la surveillance du circuit médicamenteux des essais cliniques
Documents sources
Compte rendus et notes dossiers
Principes d’organisation d’un essai clinique en médecine libérale
Coût et convention d’un essai à l’hôpital et dans l’industrie
La qualité en recherche clinique – Procédures Opératoires Standards (POS)
Introduction au data management
Introduction aux bases de données
TP/TD Access/Data
TD Objectifs et préparation de la visite de mise en place (MEP)
TD Monitoring
TD Conception/Élaboration d’un CRF
TD Rédaction de compte rendus, notes d’information, consentements, procédures opératoires standard
TD Événements indésirables/indésirables graves

Historique et organisation actuelle des systèmes de Pharmacovigilance français et européens
Les différents métiers au sein des structures publiques et privies
Organisation du dispositif d’Addictovigilance en France
Surveillance du médicament après l’AMM
La vigilance des essais cliniques
Outils – Communication en cas d’alertes
Protocoles, CRF et plans de soin
Notions de pharmaco-épidémiologie : PASS, PAES
Plan de Gestion des Risques – De la théorie à la pratique
Cas des erreurs médicamenteuses avérées et risque d’erreurs
Pharmacodépendance
Applications, cas cliniques pratiques et notifications
Place des personnels support dans les études observationnelles en pharmacovigilance et en pharmacodépendance
Études de cas en pharmacovigilance et en pharmacodépendance
Iatrogénie
Iatrogénie médicamenteuse
Spécificités de la gestion d’un effet indésirable au sein d’un CRPV
Gestion de la qualité (Intervenants académique et Industriel)
Applications aux principaux systèmes « organe classe » et populations

Organisation et structure des centres de ressources biologiques
Démarche qualité dans le suivi des prélèvements
Contexte normatif dans un CRB
TP : Manipulation de transformation d’échantillons
Écriture de modes opératoires
Traçabilité des données d’un échantillon (saisie sur base de données)
Gestion de non-conformité

Introduction sur les biomarqueurs : Définition, Intérêts et limites
Mise à niveau sur le génome humain et technique d’étude en génétique
Les Biomarqueurs d’efficacité / toxicité
Analyse des variants de significations inconnus et nouvelles technologies (NGS)
Etudes d’associations et environnement
Biostatistique liée aux études de PG de grande échelle (GWAS et autres)
Métabolomique et ses applications
Pharmacogénomique et bases de données Informatiques
Pharmacogénétique des cibles du médicament Biomarqueurs en hepatocancérologie.
Point de vue industriel et développement des tests compagnons associés aux thérapies ciblées Pharmacogénétique des enzymes du métabolisme des médicaments
Epigénétique et ses applications : exemple de la douleur
Tests génétiques et phénotypages
Ethique et comment écrire un consentement pour étude observationnelle et cohorte
Valorisation de la recherche
Juridiction des brevets Expérience avec les brevets Médecine personnalisée selon la génétique enjeux cliniques et économiques
Médecine personnalisée en Transplantation rénale et Immunosuppresseurs
Etude génétique du Microbiote appliquée aux pathologies hépatiques
Pharmacogénétique dans la Polyarthrite Rhumatoïde
Pharmacogénétique des antidepresseurs
Pharmacogénétique des psychotropes
Etude Epigénétique dans différentes pathologies
Epigenetique et Pseudo hypoparathyroidie
Illustration des Biomarqueurs en cancérologie
Biomarqueurs et cancer du colon
Oncogénétique constitutionnelle
Consultation de génétique, Application à l’HTAP
Protéomique et phénotypage
Pharmacogénétique des anticoagulants
Pharmacogénétique des antiagrégants
Pharmacogénétique des statines et des antidiabétiques
Pharmacogénétique des EI médicamenteux d’origine immunoallergique
De la Rédaction de protocole à l’aide méthodologique et à leur mise en place
Mise en place d’un projet sur biomarqueurs
Visite d’une plateforme d’oncogénétique