Ce cours est NON validant pour le DIU CESAM
| Responsable |
| Yassin MAZROUI |
Objectifs
Ce cours, à vocation résolument pratique, est accessible prioritairement aux titulaires du DIU-CESAM, ou de diplômes jugés équivalents, et met l’accent sur l’utilisation du logiciel dans la démarche statistique, de la gestion des données à la modélisation. Les notions statistiques de base étant supposées acquises, ce cours sera donc orienté sur la mise en pratique des méthodes biostatistiques essentielles à la recherche clinique, l’épidémiologie et l’analyse de données biomédicales (comparaisons de deux groupes, analyse de variance, régression linéaire et logistique, analyse de données survie, analyse de données catégorielles, …) sur ordinateur (PC ou Mac).
Organisation pédagogique:
– Cours-TD: Les étudiants sont invités à suivre ces enseignements à distance (en visio). L’enregistrement du Cours-TD sera disponible et réalisé via Panopto. Les supports de cours (diapos/documents) seront disponibles dès le début du module pendant toute la durée de la formation.
Programme
SÉANCES R:
Semaine 1 : Introduction à la programmation en R
– Présentation de R et R Studio
– Introduction à la programmation en R
– Importation de données
– Formats de données
– Manipulation des vecteurs
Semaine 2 : Analyse descriptives
– Manipulations des listes et tableaux de données
– Data management
– Statistiques descriptives pour une variable qualitative et quantitative
– Représentations graphique
Semaine 3 : Mesures et tests d’association entre deux variables
– Data management (2)
– Principaux tests de comparaison (moyennes, proportions)
Semaine 4 : Analyse de variance et plans d’expériences
– Description des données
– ANOVA à un facteur
– ANOVA à 2 facteurs
– ANOVA non paramétrique
Semaine 5 : Corrélation et régression linéaire
– Blocs d’instruction, tests logiques et boucles
– Programmation fonctionnelle
– Corrélation, régression linéaire
Semaine 6 : Mesures d’association en épidémiologie et régression logistique
– Tableaux de contingence et mesures d’association- Programmation fonctionnelle
– Etudes diagnostiques
– Régression logistique
– Courbe ROC
SÉANCES SAS :
Semaines 7 : Éléments du langage, Gestion de données, Statistiques descriptives
– Introduction à SAS (SAS 9.4 ou SAS Studio)
– Création de tables SAS, base de données
– Procédure élémentaires et analyse descriptive
– Manipulation de données
Semaine 8 : Mesures d’association et comparaison pour deux variables
– Comparaison de moyennes
– Comparaison de proportion
– Mesures d’association et tableau de contingence
Semaine 9 : Régression linéaire et Analyse de variance et régression logistique
– Procédure élémentaires et analyse descriptive
– manipulation de données
– modèle de régression linéaire
– régression logistique
– Analyse de variance à 1 ou 2 facteurs
Date et durée
L’enseignement dure 9 semaines, du 15 novembre 2023 au 26 janvier 2024
Chaque semaine comporte une séance de 3h qui comprend une synthèse de cours et la correction des exercices, le vendredi de 18h00 à 21h00.
Validation
La validation du cours consistera en un examen, sur machine à la fin du cursus.
Épreuve de 2h
Examen session 1 : Jeudi 8 février 2024
Examen session 2 : Jeudi 4 avril 2024
Contact
Karine NEEL - 3e étage - Porte 318
Faculté de médecine Sorbonne Université
Site Saint-Antoine / Boite Courrier 2912 (dans le hall à gauche)
27 rue Chaligny
75571 Paris Cedex 12
Tél. : 01 40 01 14 45
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