Cours d’informatique

Ce cours est  NON validant pour le DIU CESAM

Responsable
Yassin MAZROUI

Objectifs

Ce cours, à vocation résolument pratique, est accessible prioritairement aux titulaires du DIU-CESAM, ou de diplômes jugés équivalents, et met l’accent sur l’utilisation du logiciel dans la démarche statistique, de la gestion des données à la modélisation. Les notions statistiques de base étant supposées acquises, ce cours sera donc orienté sur la mise en pratique des méthodes biostatistiques essentielles à la recherche clinique, l’épidémiologie et l’analyse de données biomédicales (comparaisons de deux groupes, analyse de variance, régression linéaire et logistique, analyse de données survie, analyse de données catégorielles, …) sur ordinateur (PC ou Mac).

Programme

Analyses statistiques avec R

Semaine 1 : Introduction à la programmation en R

  • Présentation de R et R Studio
  • Introduction à la programmation en R
  • Importation de données
  • Formats de données
  • Manipulation des vecteurs

Semaine 2 : Analyse descriptives

  • Manipulations des listes et tableaux de données
  • Data management (1)
  • Statistiques descriptives pour une variable qualitative et quantitative
  • Représentations graphique

Semaine 3 : Mesures et tests d’association entre deux variables

  • Data management (2)
  • Principaux tests de comparaison (moyennes, proportions)

Semaine 4 : Analyse de variance et plans d’expériences

  • Description des données
  • ANOVA à un facteur
  • ANOVA à 2 facteurs
  • ANOVA non paramétrique

Semaine 5 : Corrélation et régression linéaire et régression logistique

  • Blocs d’instruction, tests logiques et boucles
  • Programmation fonctionnelle
  • Corrélation, régression linéaire
  • régression logistique

Analyses statistiques avec SAS

Semaines 6 : Éléments du langage, Gestion de données, Statistiques descriptives

  • Introduction à SAS (SAS 9.4 ou SAS Studio)
  • Création de tables SAS, base de données
  • Procédure élémentaires et analyse descriptive
  • Manipulation de données

Semaine 7 : Mesures d’association et comparaison pour deux variables

  • Comparaison de moyennes
  • Comparaison de proportion
  • Mesures d’association et tableau de contingence
  • Introduction au langage MACRO (1/2)

Semaine 8 : Régression linéaire et Analyse de variance et régression logistique

  • Procédure élémentaires et analyse descriptive
  • manipulation de données
  • modèle de régression linéaire
  • régression logistique
  • Analyse de variance à 1 ou 2 facteurs
Organisation

Enseignement sur place ou par correspondance

L’enseignement dure 8 semaines, du 16 novembre 2022 au 20 janvier 2023
Chaque semaine comprend un cours de 2h le mercredi de 18h à 20h  + Travaux pratiques de 3h, le vendredi de 18h à 21h

– Cours : Les étudiants sont invités à suivre ces enseignements EN DIRECT (en visio pendant le cours). L’enregistrement du cours sera disponible et réalisé via Panopto. Les supports de cours (diapos/documents) sont en ligne après le cours et pendant toute la durée de la formation.

– TD: Les étudiants sont invités à suivre ces enseignements EN DIRECT (en visio). L’enregistrement du TD sera disponible et réalisé via Panopto. Les corrigés sont en ligne après la séance et pendant toute la durée de la formation.

Validation

La validation du cours consistera en un examen, sur machine à la fin du cursus.

Épreuve de 2h

Examen session 1 : semaine du 13 février 2023, 18h à 20h
Examen session 2 : mai 2023, 18h à 20h

 

 

 
 

Contact

Karine NEEL - 3e étage - Porte 318
Faculté de médecine Sorbonne Université
Site Saint-Antoine / Boite Courrier  2912 (dans le hall à gauche)
27 rue Chaligny
75571 Paris Cedex 12

Tél. :  01 40 01 14 45